Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms