Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms