Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms