Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RTL8BQ17RB0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RTL8BQ17RB0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RTL8BQ17RB0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RTL8BQ17RB0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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RTL8BQ17RB0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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