Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN3Q16667 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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