Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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