Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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