Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK5Q16478 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2433.6 ms