Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms