Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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