Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PUM3Q15397 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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