Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF4Q15306 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms