Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms