Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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SHROOM2Q13796 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHROOM2Q13796 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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