Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms