Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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