Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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MTMR3Q13615 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MTMR3Q13615 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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