Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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