Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PLD1Q13393 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLD1Q13393 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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