Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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