Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms