Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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BNIP1Q12981 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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