Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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