Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms