Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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