Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TROQ12816 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TROQ12816 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TROQ12816 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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