Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms