Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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