Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms