Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL9Q07325 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms