Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNASELQ05823 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms