Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CD164Q04900 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms