Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6Q03468 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms