Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms