Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms