Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL049636.1-201ENST00000455736 1357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 COA6-204ENST00000619305 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AL031601.2-201ENST00000622823 457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms