Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms