Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms