Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POU5F1Q01860 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms