Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms