Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPTBN1Q01082 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms