Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms