Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD3P84022 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms