Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX1P78337 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms