Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP46P62068 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP46P62068 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP46P62068 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP46P62068 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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