Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms