Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THOP1P52888 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THOP1P52888 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THOP1P52888 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms