Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB28P51157 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB28P51157 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms