Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A6P48664 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms