Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCAMP43121 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCAMP43121 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCAMP43121 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms